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diff --git a/tests/micropython/import_mpy_native.py b/tests/micropython/import_mpy_native.py
index 449371dda..73e20694c 100644
--- a/tests/micropython/import_mpy_native.py
+++ b/tests/micropython/import_mpy_native.py
@@ -11,7 +11,8 @@ except (ImportError, AttributeError):
     raise SystemExit
 
 mpy_arch = usys.implementation._mpy >> 8
-if mpy_arch == 0:
+if mpy_arch >> 2 == 0:
+    # This system does not support .mpy files containing native code
     print("SKIP")
     raise SystemExit
 
@@ -54,8 +55,8 @@ class UserFS:
 valid_header = bytes([77, 6, mpy_arch, 31])
 # fmt: off
 user_files = {
-    # bad architecture
-    '/mod0.mpy': b'M\x06\xfc\x1f',
+    # bad architecture (mpy_arch needed for sub-version)
+    '/mod0.mpy': bytes([77, 6, 0xfc | mpy_arch, 31]),
 
     # test loading of viper and asm
     '/mod1.mpy': valid_header + (
diff --git a/tests/micropython/import_mpy_native_gc.py b/tests/micropython/import_mpy_native_gc.py
index bc8dcafdc..e18720fb3 100644
--- a/tests/micropython/import_mpy_native_gc.py
+++ b/tests/micropython/import_mpy_native_gc.py
@@ -46,24 +46,26 @@ class UserFS:
 
 
 # Pre-compiled examples/natmod/features0 example for various architectures, keyed
-# by the required value of sys.implementation._mpy.
+# by the required value of sys.implementation._mpy (without sub-version).
 features0_file_contents = {
     # -march=x64
-    0x806: b'M\x06\x08\x1f\x02\x004build/features0.native.mpy\x00\x12factorial\x00\x8a\x02\xe9/\x00\x00\x00SH\x8b\x1d\x83\x00\x00\x00\xbe\x02\x00\x00\x00\xffS\x18\xbf\x01\x00\x00\x00H\x85\xc0u\x0cH\x8bC \xbe\x02\x00\x00\x00[\xff\xe0H\x0f\xaf\xf8H\xff\xc8\xeb\xe6ATUSH\x8b\x1dQ\x00\x00\x00H\x8bG\x08L\x8bc(H\x8bx\x08A\xff\xd4H\x8d5+\x00\x00\x00H\x89\xc5H\x8b\x059\x00\x00\x00\x0f\xb7x\x02\xffShH\x89\xefA\xff\xd4H\x8b\x03[]A\\\xc3\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x05\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x10\x11$\r&\xa3 \x01"\xff',
+    0x806: b'M\x06\x09\x1f\x02\x004build/features0.native.mpy\x00\x12factorial\x00\x8a\x02\xe9/\x00\x00\x00SH\x8b\x1d\x83\x00\x00\x00\xbe\x02\x00\x00\x00\xffS\x18\xbf\x01\x00\x00\x00H\x85\xc0u\x0cH\x8bC \xbe\x02\x00\x00\x00[\xff\xe0H\x0f\xaf\xf8H\xff\xc8\xeb\xe6ATUSH\x8b\x1dQ\x00\x00\x00H\x8bG\x08L\x8bc(H\x8bx\x08A\xff\xd4H\x8d5+\x00\x00\x00H\x89\xc5H\x8b\x059\x00\x00\x00\x0f\xb7x\x02\xffShH\x89\xefA\xff\xd4H\x8b\x03[]A\\\xc3\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x05\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x10\x11$\r&\xa3 \x01"\xff',
     # -march=armv6m
-    0x1006: b"M\x06\x10\x1f\x02\x004build/features0.native.mpy\x00\x12factorial\x00\x88\x02\x18\xe0\x00\x00\x10\xb5\tK\tJ{D\x9cX\x02!\xe3h\x98G\x03\x00\x01 \x00+\x02\xd0XC\x01;\xfa\xe7\x02!#i\x98G\x10\xbd\xc0Fj\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf8\xb5\nN\nK~D\xf4XChgiXh\xb8G\x05\x00\x07K\x08I\xf3XyDX\x88ck\x98G(\x00\xb8G h\xf8\xbd\xc0F:\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x04\x00\x00\x00\x1e\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x05\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x10\x11<\r>\xa38\x01:\xff",
+    0x1006: b"M\x06\x11\x1f\x02\x004build/features0.native.mpy\x00\x12factorial\x00\x88\x02\x18\xe0\x00\x00\x10\xb5\tK\tJ{D\x9cX\x02!\xe3h\x98G\x03\x00\x01 \x00+\x02\xd0XC\x01;\xfa\xe7\x02!#i\x98G\x10\xbd\xc0Fj\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf8\xb5\nN\nK~D\xf4XChgiXh\xb8G\x05\x00\x07K\x08I\xf3XyDX\x88ck\x98G(\x00\xb8G h\xf8\xbd\xc0F:\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x04\x00\x00\x00\x1e\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x05\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x10\x11<\r>\xa38\x01:\xff",
 }
 
 # Populate armv7m-derived archs based on armv6m.
 for arch in (0x1406, 0x1806, 0x1C06, 0x2006):
     features0_file_contents[arch] = features0_file_contents[0x1006]
 
-if sys.implementation._mpy not in features0_file_contents:
+# Check that a .mpy exists for the target (ignore sub-version in lookup).
+sys_implementation_mpy = sys.implementation._mpy & ~(3 << 8)
+if sys_implementation_mpy not in features0_file_contents:
     print("SKIP")
     raise SystemExit
 
 # These are the test .mpy files.
-user_files = {"/features0.mpy": features0_file_contents[sys.implementation._mpy]}
+user_files = {"/features0.mpy": features0_file_contents[sys_implementation_mpy]}
 
 # Create and mount a user filesystem.
 uos.mount(UserFS(user_files), "/userfs")